Baert nam in 2014  afscheid van een professionele carrière die net geen 45 jaar had geduurd en waarvan 20 jaar op zee. Hij begon zijn loopbaan in 1969 als cadet van de 63ste promotie aan de Hogere Zeevaartschool in Antwerpen. In 1972 zwaaide hij er af als aspirant-officier en doorliep vervolgens de verschillende graden als stuurman aan boord van diverse  eenheden onder Belgische vlag. In 1980 promoveerde hij tot kapitein-ter-lange-omvaart (TLO) en kreeg vrijwel meteen een eerste commando: gezagvoerder op de bulkcarrier Temse van de rederij Bocimar.